Το συνέδριο «Αρχαιολογία και Κατοχή: Ελλάδα 1941-1944» συνέδεσε σε αντιπαράθεση πριν αρχίσει η ακαδημαϊκή του συζήτηση. Η θεματική του αφορά τον τρόπο με τον οποίο η αρχαιολογία αντιμετωπίζει την κατοχή της Ελλάδας από τους Γερμανούς την περίοδο 1941-1944. Αφορμή του θορύβου ήταν ένα αφίσα με ιστορική φωτογραφία. Στη φωτογραφία η σημαία της γερμανικής Βέρμαχτ κυματίζει πάνω από τον Παρθενώνα. Η συζήτηση για την επιλογή και τη χρήση της εικόνας μετέβα γρήγορα σε πολιτική αντιπαράθεση. Ο χαρακτήρας της αντιδρασης περιγράφηκε ως πολιτικά υποκινούμενος. Η αντιπαράθεση έφτασε μέχρι τη Βουλή, ενώ ακόμη δεν είχαν αρχίσει οι εργασίες του συνεδρίου. Αρχικά, ο πολιτικά υποκινούμενος θόρυβος επικάλυψε την υλικοτεχνική και επιστημονική συζήτηση.